Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Csnk1dQ9DC28 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 D6Ertd527e-203ENSMUST00000203747 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Csnk1dQ9DC28 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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