Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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CsprsQ99388 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
CsprsQ99388 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms