Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

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Length 76 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Mindy1-201ENSMUST00000039537 2800 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Cdh23-202ENSMUST00000105461 11096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Dhdh-201ENSMUST00000011526 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm10851-201ENSMUST00000192087 1685 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Zc3hav1-203ENSMUST00000114900 4944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ndufb2-205ENSMUST00000135671 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Brca2-210ENSMUST00000202313 10517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Sptan1-203ENSMUST00000100225 7892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Cmtr1-201ENSMUST00000024816 6380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Naa25-201ENSMUST00000042163 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Arhgap21-208ENSMUST00000141298 6339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Mettl14-204ENSMUST00000174323 4202 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Muc6-201ENSMUST00000062451 8650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Nos3-202ENSMUST00000115090 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Dusp6-204ENSMUST00000220291 2359 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Abcc9-206ENSMUST00000205202 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Sik2-206ENSMUST00000176824 5369 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Asph-211ENSMUST00000108339 6453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
SptssbQ925E8 Hoxa9-201ENSMUST00000048680 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
SptssbQ925E8 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
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