Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Snora73b-201ENSMUST00000083419 205 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 F12-202ENSMUST00000170921 478 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Gm44934-201ENSMUST00000208941 238 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Omt2b-201ENSMUST00000043734 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Kcnj11-205ENSMUST00000211674 3142 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Dclk1-215ENSMUST00000200352 1662 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Gm42629-201ENSMUST00000199063 1102 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Hecw1Q8K4P8 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms