Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Pou1f1-201ENSMUST00000004964 1773 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Zfand2a-201ENSMUST00000079996 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Tcf25-202ENSMUST00000108840 2582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Crebrf-203ENSMUST00000142539 2674 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Mlc1-201ENSMUST00000042594 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Mos-201ENSMUST00000105158 1449 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Tyw1-202ENSMUST00000044204 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Usp44-202ENSMUST00000216224 2449 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Rnf41-201ENSMUST00000096386 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Akap10-203ENSMUST00000108710 3394 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Med19-201ENSMUST00000102645 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Tmed3Q78IS1 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
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