Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Serpinb2-202ENSMUST00000064916 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Xlr-203ENSMUST00000114810 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm13333-201ENSMUST00000119424 781 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm5778-201ENSMUST00000171003 1072 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Xlr-201ENSMUST00000067763 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Il12rb1-205ENSMUST00000212657 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm15515-201ENSMUST00000117827 822 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm17917-201ENSMUST00000218561 953 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gm6992-201ENSMUST00000217973 1607 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scaf8Q6DID3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scaf8Q6DID3 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scaf8Q6DID3 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scaf8Q6DID3 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms