Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarca2Q6DIC0 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm12628-201ENSMUST00000122193 382 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 AA387200-201ENSMUST00000147463 1177 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gbgt1-201ENSMUST00000028172 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Ccdc153-201ENSMUST00000092426 1087 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm9129-201ENSMUST00000218173 1689 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarca2Q6DIC0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.3 ms