Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Msh6-201ENSMUST00000005503 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Ces2e-202ENSMUST00000109410 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Csnk2a1Q60737 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Csnk2a1Q60737 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Csnk2a1Q60737 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Csnk2a1Q60737 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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