Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PtprnQ60673 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PtprnQ60673 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PtprnQ60673 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Prl8a2-201ENSMUST00000018403 939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PtprnQ60673 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PtprnQ60673 Il4ra-201ENSMUST00000033004 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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PtprnQ60673 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PtprnQ60673 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PtprnQ60673 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PtprnQ60673 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PtprnQ60673 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PtprnQ60673 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms