Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUD9

Bbs12, Bardet-Biedl syndrome 12 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbs12Q5SUD9 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Pin1rt1-201ENSMUST00000099659 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Sec14l2-201ENSMUST00000003681 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Bbs12Q5SUD9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms