Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Mark4-201ENSMUST00000085715 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gipc3-201ENSMUST00000045102 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Paip2b-201ENSMUST00000058383 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
LbrQ3U9G9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.4 ms