Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Fcgr2b-203ENSMUST00000159688 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 AC158388.3-202ENSMUST00000225517 775 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm8723-201ENSMUST00000166076 820 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm8701-201ENSMUST00000169259 874 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm45135-201ENSMUST00000206787 1184 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ubxn2bQ0KL01 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms