Protein–RNA interactions for Protein: Q04888

Sox10, Transcription factor SOX-10, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox10Q04888 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Dnmt3b-209ENSMUST00000109773 4148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sox10Q04888 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms