Protein–RNA interactions for Protein: P97334

Nkx2-3, Homeobox protein Nkx-2.3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-3P97334 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Fam241b-201ENSMUST00000027719 771 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Clcn4-203ENSMUST00000210061 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nkx2-3P97334 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-3P97334 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-3P97334 Gm11331-201ENSMUST00000119764 288 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-3P97334 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-3P97334 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-3P97334 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-3P97334 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-3P97334 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-3P97334 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-3P97334 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-3P97334 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-3P97334 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-3P97334 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-3P97334 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-3P97334 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-3P97334 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-3P97334 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-3P97334 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-3P97334 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-3P97334 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-3P97334 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-3P97334 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nkx2-3P97334 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms