Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

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Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Plekha7-203ENSMUST00000181998 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Irx1P81068 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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