Protein–RNA interactions for Protein: P15620

Znf271, Zinc finger protein 271, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf271P15620 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Znf271P15620 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms