Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Stx1aO35526 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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