Protein–RNA interactions for Protein: L7N244

Gm20878, Predicted gene, 20878, mousemouse

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Length 103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20878L7N244 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Bnip3-203ENSMUST00000130500 719 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm13124-201ENSMUST00000105748 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm12286-201ENSMUST00000119246 1002 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm12266-201ENSMUST00000120311 962 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm10714-201ENSMUST00000131346 874 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
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Gm20878L7N244 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
Gm20878L7N244 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
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