Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm6211-201ENSMUST00000147973 4275 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Lcmt2-202ENSMUST00000110674 3056 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm12802-201ENSMUST00000145510 1813 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Sh3pxd2a-202ENSMUST00000111800 10380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Gm21310J3QQ23 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Tm9sf2-201ENSMUST00000026624 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Mrvi1-202ENSMUST00000125758 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Nars2-201ENSMUST00000044466 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gm21310J3QQ23 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
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