Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Terb2-201ENSMUST00000028661 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Cabp1-203ENSMUST00000112112 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm15635-202ENSMUST00000131160 917 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Top6blJ3QMY9 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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Top6blJ3QMY9 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Stim1-201ENSMUST00000033289 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Top6blJ3QMY9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Tex9-206ENSMUST00000183574 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Top6blJ3QMY9 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Top6blJ3QMY9 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Top6blJ3QMY9 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Top6blJ3QMY9 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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