Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 AC153144.2-201ENSMUST00000221766 451 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Fbxo48-201ENSMUST00000061327 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Micu1-201ENSMUST00000020311 2336 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Kifc1-201ENSMUST00000114361 2260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm3550W4VSN7 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
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