Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS0

Scube2, Signal peptide, CUB and EGF-like domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 997 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scube2Q9JJS0 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm26693-201ENSMUST00000181318 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Scube2Q9JJS0 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 C2cd4c-201ENSMUST00000059699 6729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Mpv17l-202ENSMUST00000124947 768 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Gm37017-201ENSMUST00000195266 747 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Olfr851-201ENSMUST00000064582 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Hormad1-203ENSMUST00000107154 1444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Scube2Q9JJS0 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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