Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Mir8115-201ENSMUST00000184992 119 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Ifna15-201ENSMUST00000102809 573 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 5330439B14Rik-201ENSMUST00000194811 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rb1cc1Q9ESK9 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms