Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Pdzd9Q9D9M4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Olfr887-201ENSMUST00000074681 930 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Pdzd9Q9D9M4 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms