Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Zfp341-202ENSMUST00000109702 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Capn9Q9D805 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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