Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Pex1-201ENSMUST00000006061 4433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Zc3h18-205ENSMUST00000176629 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Jak3-201ENSMUST00000051995 4019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Per1-202ENSMUST00000101004 3507 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Ptger4-201ENSMUST00000047379 3264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Ppp3cb-202ENSMUST00000159027 3831 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ccdc83Q9D4V3 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms