Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm9279-201ENSMUST00000223175 1606 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Tfpi2-201ENSMUST00000031674 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Rfx7-203ENSMUST00000183372 1457 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Sumo2-203ENSMUST00000117589 987 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm23958-201ENSMUST00000157207 105 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cxxc1Q9CWW7 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.7 ms