Protein–RNA interactions for Protein: Q99KW3

Triobp, TRIO and F-actin-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TriobpQ99KW3 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Shbg-201ENSMUST00000005334 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 AC127270.1-201ENSMUST00000221441 491 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Gng13-202ENSMUST00000172002 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Gm10312-201ENSMUST00000078515 489 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Adgrv1-206ENSMUST00000128120 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TriobpQ99KW3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms