Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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TrabdQ99JY4 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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TrabdQ99JY4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
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TrabdQ99JY4 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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TrabdQ99JY4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
TrabdQ99JY4 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms