Protein–RNA interactions for Protein: Q99JS0

Ncmap, Noncompact myelin-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcmapQ99JS0 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 H3f3b-201ENSMUST00000016703 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Rnf165-202ENSMUST00000182024 4309 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Ctsc-201ENSMUST00000032779 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Zdhhc20-205ENSMUST00000226057 2179 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Ddx55-202ENSMUST00000111438 2737 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
NcmapQ99JS0 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms