Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Arsa-202ENSMUST00000165199 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Snx8Q8CFD4 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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