Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a8-205ENSMUST00000167390 3533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Sorcs1-205ENSMUST00000209413 4398 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Adcyap1-201ENSMUST00000064775 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc3-201ENSMUST00000057608 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Man2c1-215ENSMUST00000161182 2909 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Mgme1-202ENSMUST00000110027 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Nhlrc3Q8CCH2 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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