Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5L3

Cnot2, CCR4-NOT transcription complex subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot2Q8C5L3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Ptger4-202ENSMUST00000120563 3312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Usp14-201ENSMUST00000092096 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cnot2Q8C5L3 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cnot2Q8C5L3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms