Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Foxd1Q61345 Med9os-203ENSMUST00000146334 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Mc5r-201ENSMUST00000172148 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm29707-202ENSMUST00000198744 659 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Rnf133-201ENSMUST00000063548 1308 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Foxd1Q61345 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
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Foxd1Q61345 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Fank1-201ENSMUST00000065359 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Foxd1Q61345 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Foxd1Q61345 Etv1-205ENSMUST00000160856 1474 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms