Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Rbbp4Q60972 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms