Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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CttnQ60598 Gm28380-201ENSMUST00000188800 385 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CttnQ60598 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CttnQ60598 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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CttnQ60598 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Sdf4-202ENSMUST00000097734 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CttnQ60598 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CttnQ60598 D630023F18Rik-201ENSMUST00000050047 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CttnQ60598 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CttnQ60598 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CttnQ60598 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CttnQ60598 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CttnQ60598 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CttnQ60598 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CttnQ60598 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CttnQ60598 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
CttnQ60598 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CttnQ60598 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CttnQ60598 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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CttnQ60598 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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CttnQ60598 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CttnQ60598 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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CttnQ60598 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CttnQ60598 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CttnQ60598 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Nek1-201ENSMUST00000034065 5401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CttnQ60598 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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