Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Grin2bQ01097 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Rsph14-206ENSMUST00000166088 1203 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Rsph14-207ENSMUST00000179546 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Rsph14-201ENSMUST00000009214 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Efcab14-203ENSMUST00000106524 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Grin2bQ01097 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.2 ms