Protein–RNA interactions for Protein: P97351

Rps3a, 40S ribosomal protein S3a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3aP97351 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rps3aP97351 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC12.21□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Mirt1-203ENSMUST00000181539 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
Rps3aP97351 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms