Protein–RNA interactions for Protein: P81067

Irx3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx3P81067 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Pappa-201ENSMUST00000084501 11027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Slc13a2-201ENSMUST00000001122 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Zscan30-202ENSMUST00000224144 1458 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Csrnp3-207ENSMUST00000145598 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Shtn1-202ENSMUST00000163821 3767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx3P81067 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Irx3P81067 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms