Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
Hoxd13P70217 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Prr15l-201ENSMUST00000054311 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Hoxd13P70217 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms