Protein–RNA interactions for Protein: P63279

UBE2I, SUMO-conjugating enzyme UBC9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2IP63279 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
UBE2IP63279 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms