Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Igf1-203ENSMUST00000105300 1673 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SftpdP50404 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpdP50404 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpdP50404 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SftpdP50404 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms