Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf1P39428 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
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Traf1P39428 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Traf1P39428 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Traf1P39428 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Traf1P39428 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Traf1P39428 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf1P39428 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf1P39428 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf1P39428 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Traf1P39428 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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