Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprkP35822 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprkP35822 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Spata3-207ENSMUST00000135440 732 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Spata3-201ENSMUST00000052854 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Diablo-210ENSMUST00000200247 748 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Bcap31-201ENSMUST00000002091 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
PtprkP35822 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprkP35822 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Immp2l-202ENSMUST00000132121 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprkP35822 1700099I09Rik-201ENSMUST00000167834 769 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
PtprkP35822 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
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