Protein–RNA interactions for Protein: P35123

Usp4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp4P35123 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Rspo2-203ENSMUST00000226810 3091 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Usp4P35123 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Usp4P35123 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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