Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm37419-201ENSMUST00000210705 114 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Hoxd10P28359 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm28172-201ENSMUST00000189880 506 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Hoxd10P28359 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Hoxd10P28359 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Hoxd10P28359 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Hoxd10P28359 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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Hoxd10P28359 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
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Hoxd10P28359 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Srfbp1-201ENSMUST00000025406 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Hoxd10P28359 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
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