Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

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Length 193 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Pck2-205ENSMUST00000226352 2784 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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SftpcP21841 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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SftpcP21841 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SftpcP21841 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
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SftpcP21841 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpcP21841 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpcP21841 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpcP21841 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpcP21841 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
SftpcP21841 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
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