Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Fancc-214ENSMUST00000161977 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Ssh1-201ENSMUST00000077689 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Tinf2-201ENSMUST00000007733 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
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Csn1s1P19228 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Ptprt-204ENSMUST00000109445 12082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Csn1s1P19228 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Pcdhb14-201ENSMUST00000052387 8695 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Csn1s1P19228 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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