Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ccl20O89093 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ccl20O89093 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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Ccl20O89093 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
Ccl20O89093 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
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Ccl20O89093 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Ccl20O89093 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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Ccl20O89093 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
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