Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Rdh16O54909 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Rdh16O54909 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Rdh16O54909 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Rdh16O54909 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Rdh16O54909 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Rdh16O54909 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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Rdh16O54909 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rdh16O54909 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
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